Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCAMP43121 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCAMP43121 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCAMP43121 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCAMP43121 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCAMP43121 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCAMP43121 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCAMP43121 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MCAMP43121 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCAMP43121 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCAMP43121 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCAMP43121 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCAMP43121 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCAMP43121 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MCAMP43121 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCAMP43121 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCAMP43121 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCAMP43121 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCAMP43121 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCAMP43121 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCAMP43121 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCAMP43121 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCAMP43121 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCAMP43121 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCAMP43121 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCAMP43121 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCAMP43121 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCAMP43121 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCAMP43121 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCAMP43121 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCAMP43121 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCAMP43121 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MCAMP43121 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCAMP43121 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCAMP43121 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCAMP43121 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCAMP43121 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCAMP43121 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCAMP43121 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCAMP43121 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCAMP43121 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCAMP43121 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCAMP43121 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCAMP43121 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCAMP43121 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCAMP43121 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCAMP43121 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCAMP43121 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCAMP43121 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCAMP43121 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCAMP43121 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCAMP43121 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MCAMP43121 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCAMP43121 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCAMP43121 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCAMP43121 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCAMP43121 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCAMP43121 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCAMP43121 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCAMP43121 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCAMP43121 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCAMP43121 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCAMP43121 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCAMP43121 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MCAMP43121 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MCAMP43121 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCAMP43121 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCAMP43121 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCAMP43121 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCAMP43121 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCAMP43121 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MCAMP43121 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCAMP43121 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCAMP43121 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCAMP43121 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCAMP43121 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCAMP43121 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCAMP43121 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCAMP43121 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCAMP43121 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCAMP43121 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCAMP43121 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCAMP43121 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCAMP43121 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCAMP43121 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCAMP43121 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCAMP43121 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCAMP43121 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCAMP43121 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCAMP43121 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCAMP43121 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCAMP43121 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MCAMP43121 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCAMP43121 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCAMP43121 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCAMP43121 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MCAMP43121 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCAMP43121 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCAMP43121 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCAMP43121 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms