Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMPOP42166 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMPOP42166 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMPOP42166 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMPOP42166 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMPOP42166 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMPOP42166 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMPOP42166 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMPOP42166 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMPOP42166 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMPOP42166 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMPOP42166 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMPOP42166 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMPOP42166 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TMPOP42166 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMPOP42166 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMPOP42166 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMPOP42166 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TMPOP42166 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMPOP42166 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMPOP42166 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMPOP42166 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TMPOP42166 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMPOP42166 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMPOP42166 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMPOP42166 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMPOP42166 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMPOP42166 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMPOP42166 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMPOP42166 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMPOP42166 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMPOP42166 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMPOP42166 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMPOP42166 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMPOP42166 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMPOP42166 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMPOP42166 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMPOP42166 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TMPOP42166 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TMPOP42166 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMPOP42166 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMPOP42166 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMPOP42166 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMPOP42166 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TMPOP42166 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TMPOP42166 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TMPOP42166 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMPOP42166 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMPOP42166 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMPOP42166 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMPOP42166 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMPOP42166 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMPOP42166 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMPOP42166 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TMPOP42166 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TMPOP42166 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMPOP42166 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMPOP42166 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMPOP42166 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TMPOP42166 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMPOP42166 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMPOP42166 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMPOP42166 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMPOP42166 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMPOP42166 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMPOP42166 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMPOP42166 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMPOP42166 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMPOP42166 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TMPOP42166 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMPOP42166 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMPOP42166 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMPOP42166 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMPOP42166 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMPOP42166 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMPOP42166 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TMPOP42166 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMPOP42166 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMPOP42166 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMPOP42166 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMPOP42166 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMPOP42166 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TMPOP42166 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMPOP42166 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMPOP42166 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMPOP42166 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMPOP42166 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMPOP42166 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMPOP42166 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMPOP42166 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMPOP42166 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMPOP42166 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMPOP42166 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMPOP42166 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMPOP42166 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMPOP42166 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMPOP42166 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMPOP42166 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMPOP42166 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMPOP42166 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms