Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms