Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms