Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms