Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXC13P31276 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC13P31276 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms