Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC27P30260 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC27P30260 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC27P30260 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC27P30260 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC27P30260 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC27P30260 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC27P30260 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC27P30260 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC27P30260 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC27P30260 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC27P30260 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC27P30260 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC27P30260 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC27P30260 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC27P30260 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC27P30260 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC27P30260 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC27P30260 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC27P30260 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC27P30260 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC27P30260 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC27P30260 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC27P30260 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC27P30260 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC27P30260 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC27P30260 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC27P30260 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC27P30260 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC27P30260 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC27P30260 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC27P30260 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC27P30260 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC27P30260 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC27P30260 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC27P30260 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC27P30260 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC27P30260 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC27P30260 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC27P30260 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC27P30260 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC27P30260 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC27P30260 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC27P30260 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC27P30260 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC27P30260 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC27P30260 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC27P30260 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC27P30260 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC27P30260 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC27P30260 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC27P30260 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC27P30260 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC27P30260 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC27P30260 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC27P30260 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC27P30260 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CDC27P30260 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
CDC27P30260 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC27P30260 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC27P30260 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC27P30260 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC27P30260 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC27P30260 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC27P30260 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC27P30260 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC27P30260 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC27P30260 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC27P30260 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC27P30260 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC27P30260 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC27P30260 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC27P30260 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC27P30260 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC27P30260 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC27P30260 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC27P30260 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC27P30260 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC27P30260 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC27P30260 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC27P30260 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC27P30260 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC27P30260 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC27P30260 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC27P30260 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC27P30260 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC27P30260 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC27P30260 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC27P30260 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC27P30260 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC27P30260 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC27P30260 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC27P30260 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC27P30260 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC27P30260 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC27P30260 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC27P30260 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC27P30260 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC27P30260 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC27P30260 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms