Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID4AP29374 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms