Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
DUSP1P28562 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms