Protein–RNA interactions for Protein: P28329

CHAT, Choline O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHATP28329 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHATP28329 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHATP28329 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHATP28329 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHATP28329 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHATP28329 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHATP28329 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHATP28329 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHATP28329 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHATP28329 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHATP28329 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHATP28329 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHATP28329 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHATP28329 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHATP28329 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHATP28329 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHATP28329 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHATP28329 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHATP28329 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CHATP28329 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHATP28329 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHATP28329 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHATP28329 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHATP28329 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHATP28329 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CHATP28329 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHATP28329 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHATP28329 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHATP28329 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHATP28329 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHATP28329 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHATP28329 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHATP28329 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHATP28329 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHATP28329 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHATP28329 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHATP28329 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHATP28329 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHATP28329 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHATP28329 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHATP28329 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHATP28329 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CHATP28329 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHATP28329 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHATP28329 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHATP28329 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHATP28329 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHATP28329 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHATP28329 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHATP28329 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHATP28329 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHATP28329 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHATP28329 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHATP28329 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHATP28329 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHATP28329 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHATP28329 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHATP28329 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHATP28329 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHATP28329 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHATP28329 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHATP28329 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHATP28329 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHATP28329 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHATP28329 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHATP28329 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHATP28329 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHATP28329 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHATP28329 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHATP28329 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHATP28329 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHATP28329 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHATP28329 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHATP28329 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHATP28329 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHATP28329 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHATP28329 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHATP28329 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHATP28329 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHATP28329 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHATP28329 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHATP28329 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHATP28329 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHATP28329 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHATP28329 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHATP28329 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHATP28329 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHATP28329 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHATP28329 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHATP28329 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHATP28329 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHATP28329 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHATP28329 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHATP28329 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHATP28329 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHATP28329 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHATP28329 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHATP28329 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHATP28329 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHATP28329 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms