Protein–RNA interactions for Protein: P23942

PRPH2, Peripherin-2, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPH2P23942 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRPH2P23942 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRPH2P23942 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRPH2P23942 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRPH2P23942 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRPH2P23942 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRPH2P23942 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRPH2P23942 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PRPH2P23942 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRPH2P23942 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRPH2P23942 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRPH2P23942 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRPH2P23942 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRPH2P23942 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRPH2P23942 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRPH2P23942 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRPH2P23942 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRPH2P23942 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRPH2P23942 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRPH2P23942 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRPH2P23942 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRPH2P23942 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRPH2P23942 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRPH2P23942 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRPH2P23942 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRPH2P23942 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRPH2P23942 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRPH2P23942 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRPH2P23942 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRPH2P23942 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRPH2P23942 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRPH2P23942 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRPH2P23942 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRPH2P23942 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRPH2P23942 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRPH2P23942 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRPH2P23942 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRPH2P23942 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRPH2P23942 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRPH2P23942 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRPH2P23942 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRPH2P23942 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRPH2P23942 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRPH2P23942 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRPH2P23942 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PRPH2P23942 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRPH2P23942 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRPH2P23942 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRPH2P23942 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRPH2P23942 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRPH2P23942 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRPH2P23942 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRPH2P23942 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRPH2P23942 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRPH2P23942 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRPH2P23942 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRPH2P23942 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRPH2P23942 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRPH2P23942 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRPH2P23942 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRPH2P23942 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRPH2P23942 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms