Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PTPRGP23470 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRGP23470 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
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