Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCP20941 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCP20941 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCP20941 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCP20941 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCP20941 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCP20941 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCP20941 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCP20941 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCP20941 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCP20941 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCP20941 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCP20941 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCP20941 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCP20941 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCP20941 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCP20941 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCP20941 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCP20941 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCP20941 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCP20941 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCP20941 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCP20941 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCP20941 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCP20941 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCP20941 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCP20941 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCP20941 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCP20941 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCP20941 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCP20941 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCP20941 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCP20941 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCP20941 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCP20941 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCP20941 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCP20941 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCP20941 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCP20941 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCP20941 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCP20941 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCP20941 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCP20941 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDCP20941 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCP20941 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCP20941 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCP20941 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCP20941 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCP20941 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCP20941 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCP20941 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCP20941 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCP20941 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCP20941 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCP20941 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCP20941 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCP20941 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCP20941 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCP20941 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCP20941 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCP20941 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCP20941 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCP20941 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCP20941 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCP20941 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCP20941 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCP20941 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCP20941 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCP20941 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCP20941 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDCP20941 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDCP20941 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDCP20941 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDCP20941 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDCP20941 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDCP20941 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDCP20941 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDCP20941 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PDCP20941 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PDCP20941 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDCP20941 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PDCP20941 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDCP20941 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PDCP20941 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDCP20941 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDCP20941 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDCP20941 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCP20941 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCP20941 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCP20941 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCP20941 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCP20941 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCP20941 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCP20941 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCP20941 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCP20941 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCP20941 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCP20941 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCP20941 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCP20941 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms