Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB3P16520 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB3P16520 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB3P16520 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB3P16520 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB3P16520 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB3P16520 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB3P16520 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB3P16520 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB3P16520 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB3P16520 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB3P16520 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB3P16520 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB3P16520 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB3P16520 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB3P16520 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB3P16520 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB3P16520 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB3P16520 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB3P16520 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB3P16520 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB3P16520 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB3P16520 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB3P16520 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB3P16520 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB3P16520 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB3P16520 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB3P16520 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB3P16520 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB3P16520 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB3P16520 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB3P16520 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB3P16520 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB3P16520 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB3P16520 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB3P16520 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB3P16520 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB3P16520 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB3P16520 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB3P16520 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB3P16520 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB3P16520 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB3P16520 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB3P16520 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB3P16520 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB3P16520 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB3P16520 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB3P16520 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB3P16520 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB3P16520 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB3P16520 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB3P16520 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB3P16520 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB3P16520 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB3P16520 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB3P16520 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB3P16520 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB3P16520 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB3P16520 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB3P16520 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB3P16520 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB3P16520 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB3P16520 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB3P16520 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB3P16520 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB3P16520 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB3P16520 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB3P16520 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB3P16520 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB3P16520 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB3P16520 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB3P16520 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB3P16520 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB3P16520 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB3P16520 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB3P16520 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB3P16520 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB3P16520 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB3P16520 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB3P16520 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB3P16520 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB3P16520 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB3P16520 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB3P16520 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB3P16520 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB3P16520 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB3P16520 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB3P16520 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB3P16520 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB3P16520 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB3P16520 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB3P16520 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB3P16520 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB3P16520 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB3P16520 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB3P16520 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB3P16520 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB3P16520 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB3P16520 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB3P16520 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms