Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA1P14867 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms