Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC5A1P13866 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC5A1P13866 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms