Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRG2P13727 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRG2P13727 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRG2P13727 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRG2P13727 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRG2P13727 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRG2P13727 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRG2P13727 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRG2P13727 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRG2P13727 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRG2P13727 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRG2P13727 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRG2P13727 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRG2P13727 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRG2P13727 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRG2P13727 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRG2P13727 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRG2P13727 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRG2P13727 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRG2P13727 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRG2P13727 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PRG2P13727 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRG2P13727 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRG2P13727 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRG2P13727 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRG2P13727 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRG2P13727 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRG2P13727 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRG2P13727 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRG2P13727 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRG2P13727 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PRG2P13727 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRG2P13727 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRG2P13727 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRG2P13727 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRG2P13727 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRG2P13727 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRG2P13727 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRG2P13727 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRG2P13727 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRG2P13727 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRG2P13727 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRG2P13727 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRG2P13727 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRG2P13727 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRG2P13727 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRG2P13727 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PRG2P13727 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PRG2P13727 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRG2P13727 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRG2P13727 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRG2P13727 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRG2P13727 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRG2P13727 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRG2P13727 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRG2P13727 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRG2P13727 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRG2P13727 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRG2P13727 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRG2P13727 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRG2P13727 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRG2P13727 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRG2P13727 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRG2P13727 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRG2P13727 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRG2P13727 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRG2P13727 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRG2P13727 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRG2P13727 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRG2P13727 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRG2P13727 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRG2P13727 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRG2P13727 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRG2P13727 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRG2P13727 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRG2P13727 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRG2P13727 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRG2P13727 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRG2P13727 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRG2P13727 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRG2P13727 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRG2P13727 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRG2P13727 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRG2P13727 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRG2P13727 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRG2P13727 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRG2P13727 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRG2P13727 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRG2P13727 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRG2P13727 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PRG2P13727 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PRG2P13727 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PRG2P13727 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PRG2P13727 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PRG2P13727 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PRG2P13727 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRG2P13727 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRG2P13727 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRG2P13727 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRG2P13727 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms