Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDH1P12830 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDH1P12830 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDH1P12830 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDH1P12830 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDH1P12830 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDH1P12830 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDH1P12830 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDH1P12830 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDH1P12830 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDH1P12830 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDH1P12830 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDH1P12830 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDH1P12830 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDH1P12830 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDH1P12830 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDH1P12830 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDH1P12830 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDH1P12830 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDH1P12830 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDH1P12830 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDH1P12830 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDH1P12830 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDH1P12830 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDH1P12830 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDH1P12830 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH1P12830 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH1P12830 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH1P12830 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH1P12830 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH1P12830 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH1P12830 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH1P12830 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH1P12830 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH1P12830 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH1P12830 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH1P12830 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH1P12830 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH1P12830 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH1P12830 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH1P12830 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH1P12830 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH1P12830 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH1P12830 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH1P12830 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH1P12830 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH1P12830 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH1P12830 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH1P12830 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH1P12830 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH1P12830 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH1P12830 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH1P12830 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH1P12830 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH1P12830 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH1P12830 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH1P12830 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH1P12830 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH1P12830 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH1P12830 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH1P12830 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH1P12830 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH1P12830 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH1P12830 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH1P12830 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH1P12830 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH1P12830 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH1P12830 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH1P12830 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH1P12830 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH1P12830 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH1P12830 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH1P12830 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH1P12830 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH1P12830 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH1P12830 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH1P12830 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH1P12830 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH1P12830 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH1P12830 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH1P12830 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH1P12830 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH1P12830 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH1P12830 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH1P12830 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH1P12830 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH1P12830 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH1P12830 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH1P12830 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH1P12830 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH1P12830 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH1P12830 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH1P12830 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH1P12830 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH1P12830 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH1P12830 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH1P12830 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH1P12830 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH1P12830 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH1P12830 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms