Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms