Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOP1P11387 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOP1P11387 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOP1P11387 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOP1P11387 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOP1P11387 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOP1P11387 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOP1P11387 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOP1P11387 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOP1P11387 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOP1P11387 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TOP1P11387 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOP1P11387 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOP1P11387 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOP1P11387 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOP1P11387 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOP1P11387 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOP1P11387 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOP1P11387 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOP1P11387 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOP1P11387 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOP1P11387 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TOP1P11387 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOP1P11387 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOP1P11387 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOP1P11387 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOP1P11387 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TOP1P11387 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOP1P11387 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOP1P11387 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOP1P11387 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOP1P11387 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOP1P11387 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOP1P11387 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOP1P11387 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TOP1P11387 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOP1P11387 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TOP1P11387 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TOP1P11387 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOP1P11387 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOP1P11387 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOP1P11387 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOP1P11387 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOP1P11387 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOP1P11387 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOP1P11387 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOP1P11387 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOP1P11387 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOP1P11387 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOP1P11387 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOP1P11387 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOP1P11387 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOP1P11387 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOP1P11387 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOP1P11387 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOP1P11387 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOP1P11387 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOP1P11387 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOP1P11387 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOP1P11387 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOP1P11387 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOP1P11387 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOP1P11387 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOP1P11387 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOP1P11387 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOP1P11387 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOP1P11387 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOP1P11387 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOP1P11387 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TOP1P11387 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOP1P11387 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOP1P11387 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOP1P11387 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TOP1P11387 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOP1P11387 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOP1P11387 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOP1P11387 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOP1P11387 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOP1P11387 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOP1P11387 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOP1P11387 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOP1P11387 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOP1P11387 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOP1P11387 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOP1P11387 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOP1P11387 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOP1P11387 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOP1P11387 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOP1P11387 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOP1P11387 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOP1P11387 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOP1P11387 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOP1P11387 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOP1P11387 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOP1P11387 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOP1P11387 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TOP1P11387 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOP1P11387 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOP1P11387 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOP1P11387 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms