Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL3P10147 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL3P10147 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL3P10147 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL3P10147 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL3P10147 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL3P10147 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL3P10147 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCL3P10147 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL3P10147 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL3P10147 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL3P10147 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL3P10147 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL3P10147 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL3P10147 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL3P10147 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL3P10147 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL3P10147 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL3P10147 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL3P10147 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL3P10147 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL3P10147 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL3P10147 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL3P10147 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL3P10147 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL3P10147 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL3P10147 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL3P10147 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL3P10147 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL3P10147 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL3P10147 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL3P10147 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL3P10147 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL3P10147 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL3P10147 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL3P10147 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL3P10147 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL3P10147 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL3P10147 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL3P10147 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL3P10147 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL3P10147 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL3P10147 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL3P10147 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCL3P10147 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCL3P10147 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCL3P10147 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCL3P10147 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCL3P10147 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCL3P10147 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCL3P10147 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCL3P10147 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCL3P10147 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCL3P10147 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCL3P10147 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCL3P10147 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCL3P10147 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCL3P10147 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCL3P10147 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCL3P10147 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCL3P10147 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCL3P10147 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCL3P10147 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCL3P10147 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCL3P10147 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCL3P10147 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCL3P10147 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCL3P10147 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCL3P10147 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCL3P10147 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCL3P10147 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCL3P10147 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCL3P10147 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCL3P10147 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCL3P10147 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCL3P10147 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCL3P10147 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCL3P10147 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCL3P10147 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCL3P10147 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCL3P10147 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCL3P10147 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCL3P10147 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCL3P10147 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCL3P10147 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCL3P10147 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCL3P10147 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCL3P10147 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCL3P10147 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCL3P10147 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCL3P10147 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCL3P10147 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCL3P10147 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCL3P10147 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCL3P10147 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCL3P10147 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCL3P10147 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCL3P10147 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCL3P10147 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCL3P10147 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms