Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD2P0DJD1 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms