Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SFTA3P0C7M3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms