Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXB7P09629 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms