Protein–RNA interactions for Protein: P08949

NMB, Neuromedin-B, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBP08949 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBP08949 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBP08949 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBP08949 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBP08949 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBP08949 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBP08949 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBP08949 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBP08949 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBP08949 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBP08949 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBP08949 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBP08949 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBP08949 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBP08949 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBP08949 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBP08949 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBP08949 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBP08949 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBP08949 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBP08949 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBP08949 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBP08949 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBP08949 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMBP08949 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMBP08949 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMBP08949 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMBP08949 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMBP08949 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMBP08949 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMBP08949 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMBP08949 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMBP08949 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMBP08949 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMBP08949 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMBP08949 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMBP08949 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMBP08949 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMBP08949 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMBP08949 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMBP08949 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMBP08949 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NMBP08949 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMBP08949 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMBP08949 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMBP08949 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMBP08949 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMBP08949 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMBP08949 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMBP08949 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NMBP08949 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMBP08949 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMBP08949 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMBP08949 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMBP08949 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMBP08949 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMBP08949 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMBP08949 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMBP08949 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMBP08949 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMBP08949 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMBP08949 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMBP08949 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMBP08949 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMBP08949 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMBP08949 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMBP08949 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMBP08949 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMBP08949 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMBP08949 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NMBP08949 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMBP08949 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NMBP08949 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMBP08949 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMBP08949 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMBP08949 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMBP08949 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NMBP08949 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NMBP08949 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NMBP08949 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NMBP08949 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NMBP08949 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NMBP08949 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NMBP08949 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NMBP08949 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NMBP08949 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMBP08949 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMBP08949 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMBP08949 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMBP08949 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMBP08949 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMBP08949 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMBP08949 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMBP08949 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMBP08949 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMBP08949 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMBP08949 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMBP08949 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMBP08949 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMBP08949 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms