Protein–RNA interactions for Protein: P08865

RPSA, 40S ribosomal protein SA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP08865 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPSAP08865 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPSAP08865 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPSAP08865 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPSAP08865 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPSAP08865 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPSAP08865 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPSAP08865 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPSAP08865 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPSAP08865 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPSAP08865 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPSAP08865 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPSAP08865 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPSAP08865 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPSAP08865 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPSAP08865 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPSAP08865 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPSAP08865 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RPSAP08865 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPSAP08865 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPSAP08865 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPSAP08865 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPSAP08865 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPSAP08865 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPSAP08865 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPSAP08865 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPSAP08865 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPSAP08865 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPSAP08865 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPSAP08865 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPSAP08865 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPSAP08865 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPSAP08865 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPSAP08865 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPSAP08865 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPSAP08865 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPSAP08865 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPSAP08865 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPSAP08865 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPSAP08865 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPSAP08865 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPSAP08865 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPSAP08865 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPSAP08865 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPSAP08865 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPSAP08865 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPSAP08865 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPSAP08865 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPSAP08865 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPSAP08865 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RPSAP08865 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPSAP08865 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPSAP08865 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPSAP08865 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPSAP08865 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPSAP08865 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPSAP08865 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPSAP08865 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPSAP08865 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPSAP08865 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPSAP08865 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPSAP08865 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPSAP08865 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPSAP08865 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPSAP08865 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPSAP08865 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPSAP08865 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPSAP08865 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPSAP08865 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPSAP08865 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPSAP08865 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPSAP08865 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPSAP08865 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPSAP08865 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPSAP08865 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPSAP08865 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPSAP08865 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPSAP08865 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPSAP08865 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPSAP08865 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPSAP08865 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPSAP08865 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPSAP08865 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPSAP08865 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPSAP08865 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPSAP08865 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPSAP08865 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPSAP08865 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPSAP08865 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPSAP08865 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPSAP08865 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPSAP08865 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPSAP08865 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPSAP08865 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPSAP08865 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPSAP08865 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPSAP08865 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPSAP08865 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPSAP08865 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPSAP08865 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms