Protein–RNA interactions for Protein: P07195

LDHB, L-lactate dehydrogenase B chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHBP07195 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHBP07195 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHBP07195 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHBP07195 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDHBP07195 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LDHBP07195 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDHBP07195 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDHBP07195 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDHBP07195 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDHBP07195 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDHBP07195 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDHBP07195 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDHBP07195 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LDHBP07195 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDHBP07195 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LDHBP07195 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDHBP07195 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDHBP07195 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDHBP07195 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDHBP07195 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDHBP07195 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDHBP07195 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDHBP07195 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDHBP07195 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDHBP07195 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDHBP07195 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDHBP07195 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDHBP07195 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDHBP07195 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDHBP07195 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LDHBP07195 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDHBP07195 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDHBP07195 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDHBP07195 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LDHBP07195 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDHBP07195 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDHBP07195 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDHBP07195 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDHBP07195 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDHBP07195 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LDHBP07195 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDHBP07195 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDHBP07195 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDHBP07195 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDHBP07195 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDHBP07195 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDHBP07195 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDHBP07195 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDHBP07195 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDHBP07195 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDHBP07195 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDHBP07195 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDHBP07195 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDHBP07195 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDHBP07195 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDHBP07195 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDHBP07195 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LDHBP07195 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDHBP07195 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDHBP07195 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDHBP07195 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDHBP07195 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDHBP07195 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDHBP07195 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LDHBP07195 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDHBP07195 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDHBP07195 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDHBP07195 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LDHBP07195 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDHBP07195 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDHBP07195 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDHBP07195 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDHBP07195 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDHBP07195 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDHBP07195 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDHBP07195 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LDHBP07195 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDHBP07195 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LDHBP07195 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDHBP07195 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LDHBP07195 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LDHBP07195 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDHBP07195 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDHBP07195 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LDHBP07195 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDHBP07195 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDHBP07195 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDHBP07195 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDHBP07195 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDHBP07195 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDHBP07195 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDHBP07195 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDHBP07195 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDHBP07195 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDHBP07195 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDHBP07195 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDHBP07195 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDHBP07195 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDHBP07195 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDHBP07195 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms