Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR3DP05423 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR3DP05423 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR3DP05423 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3DP05423 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3DP05423 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3DP05423 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3DP05423 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3DP05423 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3DP05423 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3DP05423 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3DP05423 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3DP05423 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3DP05423 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3DP05423 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3DP05423 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3DP05423 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3DP05423 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3DP05423 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3DP05423 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3DP05423 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3DP05423 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3DP05423 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3DP05423 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR3DP05423 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR3DP05423 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR3DP05423 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR3DP05423 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR3DP05423 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR3DP05423 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR3DP05423 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR3DP05423 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR3DP05423 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR3DP05423 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR3DP05423 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR3DP05423 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR3DP05423 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR3DP05423 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR3DP05423 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR3DP05423 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR3DP05423 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR3DP05423 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR3DP05423 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR3DP05423 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR3DP05423 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR3DP05423 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR3DP05423 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR3DP05423 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR3DP05423 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR3DP05423 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR3DP05423 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR3DP05423 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR3DP05423 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR3DP05423 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR3DP05423 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR3DP05423 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR3DP05423 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR3DP05423 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR3DP05423 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR3DP05423 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR3DP05423 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR3DP05423 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
POLR3DP05423 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
POLR3DP05423 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
POLR3DP05423 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR3DP05423 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR3DP05423 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR3DP05423 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR3DP05423 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR3DP05423 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR3DP05423 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR3DP05423 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR3DP05423 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR3DP05423 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR3DP05423 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR3DP05423 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR3DP05423 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR3DP05423 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR3DP05423 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR3DP05423 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR3DP05423 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR3DP05423 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR3DP05423 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR3DP05423 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR3DP05423 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR3DP05423 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR3DP05423 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR3DP05423 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR3DP05423 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR3DP05423 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR3DP05423 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR3DP05423 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR3DP05423 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR3DP05423 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR3DP05423 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR3DP05423 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR3DP05423 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR3DP05423 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR3DP05423 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR3DP05423 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms