Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-DQB1P01920 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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