Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCNTO95613 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCNTO95613 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCNTO95613 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCNTO95613 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCNTO95613 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PCNTO95613 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCNTO95613 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PCNTO95613 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCNTO95613 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCNTO95613 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCNTO95613 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCNTO95613 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCNTO95613 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCNTO95613 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCNTO95613 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCNTO95613 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCNTO95613 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCNTO95613 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PCNTO95613 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCNTO95613 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCNTO95613 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCNTO95613 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCNTO95613 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCNTO95613 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCNTO95613 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCNTO95613 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCNTO95613 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCNTO95613 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCNTO95613 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCNTO95613 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCNTO95613 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCNTO95613 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCNTO95613 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCNTO95613 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PCNTO95613 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCNTO95613 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCNTO95613 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCNTO95613 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCNTO95613 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCNTO95613 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCNTO95613 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCNTO95613 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCNTO95613 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCNTO95613 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCNTO95613 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCNTO95613 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCNTO95613 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCNTO95613 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCNTO95613 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCNTO95613 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCNTO95613 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCNTO95613 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCNTO95613 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCNTO95613 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCNTO95613 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCNTO95613 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCNTO95613 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCNTO95613 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCNTO95613 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCNTO95613 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCNTO95613 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCNTO95613 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCNTO95613 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCNTO95613 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCNTO95613 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCNTO95613 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCNTO95613 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCNTO95613 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCNTO95613 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCNTO95613 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCNTO95613 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCNTO95613 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCNTO95613 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCNTO95613 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PCNTO95613 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCNTO95613 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCNTO95613 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCNTO95613 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PCNTO95613 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCNTO95613 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PCNTO95613 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCNTO95613 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PCNTO95613 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCNTO95613 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCNTO95613 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCNTO95613 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCNTO95613 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCNTO95613 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCNTO95613 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCNTO95613 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PCNTO95613 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCNTO95613 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PCNTO95613 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCNTO95613 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCNTO95613 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCNTO95613 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PCNTO95613 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCNTO95613 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PCNTO95613 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms