Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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PDE6DO43924 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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PDE6DO43924 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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PDE6DO43924 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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PDE6DO43924 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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PDE6DO43924 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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PDE6DO43924 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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PDE6DO43924 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDE6DO43924 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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