Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SYNGR2O43760 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR2O43760 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms