Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ARPC5O15511 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms