Protein–RNA interactions for Protein: O15438

ABCC3, Canalicular multispecific organic anion transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC3O15438 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ABCC3O15438 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCC3O15438 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCC3O15438 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCC3O15438 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCC3O15438 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCC3O15438 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCC3O15438 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCC3O15438 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCC3O15438 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCC3O15438 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCC3O15438 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCC3O15438 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCC3O15438 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCC3O15438 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCC3O15438 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCC3O15438 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCC3O15438 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCC3O15438 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms