Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PHOX2AO14813 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHOX2AO14813 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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