Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms