Protein–RNA interactions for Protein: J3QW42

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QW42 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
J3QW42 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
J3QW42 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
J3QW42 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
J3QW42 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
J3QW42 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
J3QW42 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
J3QW42 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3QW42 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3QW42 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3QW42 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3QW42 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3QW42 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3QW42 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3QW42 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3QW42 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3QW42 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3QW42 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3QW42 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3QW42 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3QW42 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3QW42 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
J3QW42 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3QW42 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3QW42 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3QW42 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3QW42 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3QW42 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3QW42 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3QW42 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3QW42 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
J3QW42 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
J3QW42 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3QW42 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3QW42 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3QW42 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3QW42 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
J3QW42 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3QW42 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3QW42 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3QW42 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QW42 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QW42 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QW42 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QW42 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QW42 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QW42 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QW42 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QW42 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QW42 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QW42 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QW42 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QW42 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QW42 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QW42 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QW42 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QW42 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QW42 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QW42 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QW42 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QW42 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QW42 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QW42 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QW42 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QW42 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QW42 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QW42 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QW42 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QW42 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QW42 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QW42 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QW42 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QW42 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QW42 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QW42 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QW42 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QW42 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QW42 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QW42 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QW42 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QW42 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QW42 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QW42 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QW42 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QW42 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QW42 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QW42 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QW42 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QW42 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QW42 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QW42 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QW42 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QW42 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QW42 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QW42 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QW42 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QW42 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3QW42 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3QW42 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3QW42 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms