Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GOLGA8SH3BPF8 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GOLGA8SH3BPF8 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GOLGA8SH3BPF8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GOLGA8SH3BPF8 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GOLGA8SH3BPF8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GOLGA8SH3BPF8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GOLGA8SH3BPF8 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GOLGA8SH3BPF8 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOLGA8SH3BPF8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOLGA8SH3BPF8 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOLGA8SH3BPF8 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOLGA8SH3BPF8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOLGA8SH3BPF8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOLGA8SH3BPF8 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GOLGA8SH3BPF8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOLGA8SH3BPF8 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOLGA8SH3BPF8 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOLGA8SH3BPF8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOLGA8SH3BPF8 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOLGA8SH3BPF8 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOLGA8SH3BPF8 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOLGA8SH3BPF8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOLGA8SH3BPF8 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GOLGA8SH3BPF8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOLGA8SH3BPF8 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GOLGA8SH3BPF8 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOLGA8SH3BPF8 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOLGA8SH3BPF8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOLGA8SH3BPF8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOLGA8SH3BPF8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOLGA8SH3BPF8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOLGA8SH3BPF8 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOLGA8SH3BPF8 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOLGA8SH3BPF8 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOLGA8SH3BPF8 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOLGA8SH3BPF8 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOLGA8SH3BPF8 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOLGA8SH3BPF8 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOLGA8SH3BPF8 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOLGA8SH3BPF8 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOLGA8SH3BPF8 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GOLGA8SH3BPF8 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOLGA8SH3BPF8 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOLGA8SH3BPF8 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GOLGA8SH3BPF8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOLGA8SH3BPF8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOLGA8SH3BPF8 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOLGA8SH3BPF8 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA8SH3BPF8 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms