Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HMGB1P1B2RPK0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HMGB1P1B2RPK0 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms