Protein–RNA interactions for Protein: A9Z1Z3

FER1L4, Fer-1-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FER1L4A9Z1Z3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC27.56■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC27.55■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC27.55■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC27.54■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC27.54■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC27.53■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC27.53■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC27.53■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.53■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC27.53■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC27.52■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FER1L4A9Z1Z3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FER1L4A9Z1Z3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FER1L4A9Z1Z3 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
FER1L4A9Z1Z3 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FER1L4A9Z1Z3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FER1L4A9Z1Z3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FER1L4A9Z1Z3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FER1L4A9Z1Z3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FER1L4A9Z1Z3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FER1L4A9Z1Z3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FER1L4A9Z1Z3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FER1L4A9Z1Z3 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
FER1L4A9Z1Z3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
FER1L4A9Z1Z3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FER1L4A9Z1Z3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FER1L4A9Z1Z3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FER1L4A9Z1Z3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FER1L4A9Z1Z3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FER1L4A9Z1Z3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
FER1L4A9Z1Z3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FER1L4A9Z1Z3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FER1L4A9Z1Z3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FER1L4A9Z1Z3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms