Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
A8MVJ9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
A8MVJ9 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
A8MVJ9 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
A8MVJ9 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
A8MVJ9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
A8MVJ9 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
A8MVJ9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
A8MVJ9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
A8MVJ9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
A8MVJ9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
A8MVJ9 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
A8MVJ9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
A8MVJ9 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
A8MVJ9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
A8MVJ9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
A8MVJ9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
A8MVJ9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
A8MVJ9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
A8MVJ9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
A8MVJ9 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
A8MVJ9 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
A8MVJ9 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
A8MVJ9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
A8MVJ9 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
A8MVJ9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
A8MVJ9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
A8MVJ9 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
A8MVJ9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
A8MVJ9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
A8MVJ9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
A8MVJ9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
A8MVJ9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
A8MVJ9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
A8MVJ9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
A8MVJ9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
A8MVJ9 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
A8MVJ9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
A8MVJ9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
A8MVJ9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
A8MVJ9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
A8MVJ9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
A8MVJ9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
A8MVJ9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
A8MVJ9 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
A8MVJ9 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
A8MVJ9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
A8MVJ9 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
A8MVJ9 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
A8MVJ9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
A8MVJ9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
A8MVJ9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
A8MVJ9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
A8MVJ9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
A8MVJ9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
A8MVJ9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A8MVJ9 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
A8MVJ9 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
A8MVJ9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A8MVJ9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
A8MVJ9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
A8MVJ9 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A8MVJ9 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
A8MVJ9 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A8MVJ9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
A8MVJ9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
A8MVJ9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A8MVJ9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A8MVJ9 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
A8MVJ9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
A8MVJ9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
A8MVJ9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
A8MVJ9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
A8MVJ9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
A8MVJ9 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A8MVJ9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A8MVJ9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A8MVJ9 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A8MVJ9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
A8MVJ9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A8MVJ9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
A8MVJ9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
A8MVJ9 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A8MVJ9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
A8MVJ9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
A8MVJ9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
A8MVJ9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A8MVJ9 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A8MVJ9 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
A8MVJ9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
A8MVJ9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
A8MVJ9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
A8MVJ9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
A8MVJ9 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
A8MVJ9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A8MVJ9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A8MVJ9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A8MVJ9 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A8MVJ9 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
A8MVJ9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms