Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4orf47A7E2U8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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