Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF316A6NFI3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms