Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRAMEF22A3QJZ6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRAMEF22A3QJZ6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRAMEF22A3QJZ6 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRAMEF22A3QJZ6 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PRAMEF22A3QJZ6 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PRAMEF22A3QJZ6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRAMEF22A3QJZ6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRAMEF22A3QJZ6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRAMEF22A3QJZ6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF22A3QJZ6 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF22A3QJZ6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF22A3QJZ6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF22A3QJZ6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF22A3QJZ6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF22A3QJZ6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF22A3QJZ6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF22A3QJZ6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF22A3QJZ6 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF22A3QJZ6 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF22A3QJZ6 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF22A3QJZ6 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF22A3QJZ6 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF22A3QJZ6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF22A3QJZ6 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF22A3QJZ6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF22A3QJZ6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF22A3QJZ6 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF22A3QJZ6 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF22A3QJZ6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF22A3QJZ6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF22A3QJZ6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF22A3QJZ6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF22A3QJZ6 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF22A3QJZ6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms