Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ4

KRTAP9-2, Keratin-associated protein 9-2, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-2Q9BYQ4 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 SLC35A3-201ENST00000370153 5708 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 KIF1B-211ENST00000620295 8624 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF445-202ENST00000425708 10052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 C14orf166-201ENST00000261700 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 ESR1-206ENST00000427531 5436 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 MROH3P-201ENST00000435735 2676 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 TRIM66-202ENST00000402157 10086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 BDNF-213ENST00000525950 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC010328.1-201ENST00000596769 4060 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 NEDD9-216ENST00000620854 4086 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF845-202ENST00000595091 4413 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 ADGRL3-209ENST00000508693 5009 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 ACSL1-212ENST00000622937 4103 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 TMCC3-203ENST00000551457 4361 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 NFAT5-201ENST00000349945 13362 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 PTPRT-205ENST00000373193 12681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 TNPO3-201ENST00000265388 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 SLC5A1-204ENST00000543737 4752 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 PLEKHG4B-201ENST00000283426 11515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF507-201ENST00000311921 7638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 UTY-212ENST00000545955 6817 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 MTFR1L-207ENST00000466284 3262 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 CRB1-202ENST00000367399 3885 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 URB1-201ENST00000382751 10832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 VPS13A-203ENST00000360280 15320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 PJA2-201ENST00000361189 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 CLTC-201ENST00000269122 7760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 ANK2-212ENST00000506722 8051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 SELP-201ENST00000263686 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 CDC27-201ENST00000066544 5801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 FER1L6-201ENST00000522917 6051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 MED28-201ENST00000237380 10868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 PTPN3-203ENST00000412145 8765 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 PLAGL1-205ENST00000392307 6296 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 RAB14-201ENST00000373840 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 SENP8-201ENST00000340912 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF521-203ENST00000538137 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF385D-201ENST00000281523 10699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 ROBO1-202ENST00000464233 6742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 WNT2B-203ENST00000369686 10879 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 UG0898H09-202ENST00000623646 7040 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 DDX46-201ENST00000354283 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 SLC1A2-201ENST00000278379 11696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 PGM3-212ENST00000513973 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 NRCAM-204ENST00000379028 6685 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 ITPR1-202ENST00000354582 10242 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 COL12A1-211ENST00000615798 11579 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP9-2Q9BYQ4 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.7 ms