Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ4

KRTAP9-2, Keratin-associated protein 9-2, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 USP37-201ENST00000258399 8032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 TNS1-201ENST00000171887 10331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 SRGAP1-206ENST00000543397 5652 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF471-202ENST00000591537 5859 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 PRICKLE2-205ENST00000638394 9956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 TMEM192-201ENST00000306480 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 SLFN13-209ENST00000533791 4121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 NEK1-208ENST00000512193 4430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 ABCA6-201ENST00000284425 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 HMG20A-202ENST00000381714 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 ARHGAP21-201ENST00000320481 4343 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 ITK-201ENST00000422843 4528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 ALMS1-206ENST00000613296 12925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 VANGL1-202ENST00000355485 8691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 MAVS-201ENST00000416600 11596 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 SNORA70D-201ENST00000578836 135 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC120057.5-201ENST00000623840 154 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 LRRC8B-206ENST00000640258 8034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 CARD8-202ENST00000391898 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 SVEP1-203ENST00000401783 12350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 KIF27-201ENST00000297814 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF462-204ENST00000441147 4691 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 NOTCH2-206ENST00000579475 2954 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL627309.5-201ENST00000484859 4860 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 LRP1-201ENST00000243077 14897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 OR5A2-201ENST00000302040 6318 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 FBXO40-201ENST00000338040 5929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-2Q9BYQ4 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.3 ms