Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Z2

LINC01558, Uncharacterized protein encoded by LINC01558, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01558Q9Y6Z2 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC01558Q9Y6Z2 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC01558Q9Y6Z2 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC01558Q9Y6Z2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC01558Q9Y6Z2 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC01558Q9Y6Z2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC01558Q9Y6Z2 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC01558Q9Y6Z2 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC01558Q9Y6Z2 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC01558Q9Y6Z2 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC01558Q9Y6Z2 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC01558Q9Y6Z2 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC01558Q9Y6Z2 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC01558Q9Y6Z2 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC01558Q9Y6Z2 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms