Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN6Q9Y6Q1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CAPN6Q9Y6Q1 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CAPN6Q9Y6Q1 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CAPN6Q9Y6Q1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CAPN6Q9Y6Q1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CAPN6Q9Y6Q1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CAPN6Q9Y6Q1 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CAPN6Q9Y6Q1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CAPN6Q9Y6Q1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CAPN6Q9Y6Q1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CAPN6Q9Y6Q1 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPN6Q9Y6Q1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPN6Q9Y6Q1 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPN6Q9Y6Q1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPN6Q9Y6Q1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPN6Q9Y6Q1 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPN6Q9Y6Q1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPN6Q9Y6Q1 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPN6Q9Y6Q1 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPN6Q9Y6Q1 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPN6Q9Y6Q1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPN6Q9Y6Q1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPN6Q9Y6Q1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPN6Q9Y6Q1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPN6Q9Y6Q1 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPN6Q9Y6Q1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPN6Q9Y6Q1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPN6Q9Y6Q1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPN6Q9Y6Q1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPN6Q9Y6Q1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPN6Q9Y6Q1 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPN6Q9Y6Q1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPN6Q9Y6Q1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPN6Q9Y6Q1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPN6Q9Y6Q1 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPN6Q9Y6Q1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPN6Q9Y6Q1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPN6Q9Y6Q1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPN6Q9Y6Q1 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPN6Q9Y6Q1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPN6Q9Y6Q1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPN6Q9Y6Q1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPN6Q9Y6Q1 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPN6Q9Y6Q1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPN6Q9Y6Q1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPN6Q9Y6Q1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
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