Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PARP3Q9Y6F1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms