Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX13Q9Y5W8 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX13Q9Y5W8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms